Quy chế gồm 04 chương, 12 điều, quy định cụ thể hóa mối quan hệ công tác giữa Ủy ban nhân dân và Uỷ Ban MTTQ Việt Nam và các tổ chức CT - XH đặc khu trong việc thực hiện các nhiệm vụ chính trị tại địa phương. Nội dung quy chế tập trung vào các mặt công tác trọng tâm như: Công tác bầu cử đại biểu Quốc hội và đại biểu HĐND các cấp; công tác tham gia xây dựng pháp luật; hoạt động giám sát, phản biện xã hội; công tác tuyên truyền, vận động Nhân dân thực hiện chủ trương, đường lối, chính sách của Đảng và pháp luật của Nhà nước; hoạt động tiếp xúc cử tri; công tác tiếp công dân, giải quyết khiếu nại, tố cáo của công dân; xây dựng khối đại đoàn kết toàn dân tộc, công tác tuyên truyền, giáo dục thế hệ trẻ; hỗ trợ thanh niên học tập, nghiên cứu khoa học; định hướng nghề nghiệp, giải quyết việc làm, khởi nghiệp, lập nghiệp; nâng cao thể chất, đời sống văn hóa, tinh thần, tổ chức thực hiện chính sách liên quan đến phụ nữ, trẻ em...

Việc ký kết nhằm tăng cường mối quan hệ phối hợp giữa UBND và UBMTTQVN và các tổ chức CT - XH đặc khu trong việc thực hiện nhiệm vụ chính trị; phát huy vai trò, trách nhiệm của mỗi cơ quan, bảo đảm sự lãnh đạo toàn diện, nâng cao hiệu lực, hiệu quả quản lý, điều hành, giám sát và phát huy quyền làm chủ của Nhân dân. Quy chế phối hợp là minh chứng sinh động cho tinh thần đoàn kết, thống nhất, đề cao trách nhiệm của mỗi cơ quan sau khi vận hành mô hình chính quyền địa phương 2 cấp; hướng tới xây dựng đặc khu Cồn Cỏ mạnh về kinh tế, vững về quốc phòng - an ninh.